Latar Belakang • Ditemukan enzim ligase dan restriksi endonuclease. • Menginisiasi perkembangan ilmu DNA sehingga muncul teknologi DNA rekombinan. • DNA assembly: teknologi menggabungkan potongan DNA menjadi satu untai DNA yang panjang. • Teknologi ini dapat digunakan untuk konstruksi vektor DNA, serta sebagai tools untuk molecular engineering dan biologi sintetik.
Sejarah
Gibson Assembly: Mekanisme
T5 Exonuclease
T5 Exonuclease
T5 Exonuclease
T5 Exonuclease
T5 Exonuclease
T5 Exonuclease
Phusion Polymerase
Phusion Polymerase
Phusion Polymerase
Phusion Polymerase
Taq Ligase
Taq Ligase
Gibson Assembly: Kelebihan & Kekurangan • Kelebihan 1. Tidak memerlukan sisi restriksi 2. Produk yang dihasilkan merupakan sequence yang lengkap 3. Bisa menggabungkan lebih dari 10 potongan DNA dalam 1 waktu reaksi (1 jam) • Kekurangan 1. Membutuhkan primer khusus dengan harga yang relative mahal 2.Bisa terjadi kesalahan dalam penyusunan ulang sequence namun frekuensinya rendah 3. Adanya struktur sekunder manghalangi penyusunan ulang sequence
Daftar Pustaka • Gibson, D. G. 2011. Enzymatic Assembly of Overlapping DNA Fragments. Methods in Enzymology 498: 349-361. • Gibson, D. G., L. Young, R. Y. Chuang, J. C. Venter, C. A. Hutchison, & H. O. Smith. 2009. Enzymatic Assembly of DNA Molecules up to Several Hundred Kilobases. Nature Methods (6)5: 343-345.